《经学通论》为马宗霍之子马巨据其父未成遗稿及旧著《中国经学史》等增订而成。全书分“经学导论”、“经学起源”、“群经略说”、“经学简史”四部，其大指详于各经流传原委，辨其真妄是非；刺取各史《艺文志》、《儒林传》、《选举志》等，以述官学私学始而综论一朝经学大貌，条析诸经传授源流，略举一时名儒及其著述以见流派，多从思想、政治观察经学史变迁，要言不烦，条理可寻。是作于前史记述多有考辨，皆见精当；或又发疑正读，多得其实。其所论述亦多卓识，如论晏子非儒学，经学之兴于秦一统而以为官方经学之始，辨汉学不分齐鲁，解汉世《公》《穀》立学政治因缘，楬橥新莽一朝之学；分期也多有斟酌，如分两汉为二而合曹魏于后汉，如是不一而足。偶有辩驳过当，读者自可会心，要皆好学深思，非剿袭世俗之论可比，可供学者参考。