《汉魏两晋南北朝史丛考(繁体版)》收录余嘉锡先生所撰研究两汉、魏两晋、南北朝时期历史问题的论文计九篇。涉及《史记》亡篇的考证、汉武帝时代的马政、晋代的辟雍制度、魏晋南北朝乃至隋唐士人的服药问题等。

《四库提要辨证》全书四百九十篇，其中经部六十一篇，史部一百八篇，子部二百十七篇，集部一百三篇，可以说他关注的重点，是在子、史二部，与清人的偏重经学小学有所不同。从所涉时代来看，包括了从上古到清代的各个时期，但以宋人著作为最多，达230种，接近全书的一半。凡此均可看出作者在博通中有所专擅的方面。《四库提要辨证》所涉博大精深，对近五百种书中的各种复杂难解的问题，作出了精当科学的解析。所涉如一书作者之归属、成书之始末、内容之分合、流传之完残、传本之真伪等，都有很具体的指正和发明。应该说，《四库提要》中带有明确的倾向性的偏失是很明显的，如以汉学正统之立场贬抑宋学，对西学一知半解地轻率讥评等，批评较为容易，余先生对此虽所见十分明切，但因议论可因所见不同而发挥，毋庸逐一讨论或批评，故一般较少计较。

本书是现代著名古文献学家、目录学家余嘉锡先生最重要的学术著作，著者萃毕生精力，参阅大量文献资料，成全书二十四卷共四百九十篇，依《四库全书总目提要》原次排列，每篇先摘引原文，后订正其谬误，补其阙略。书中或证其引书有误，或证其所论与事实不符，或证其所举年代有失，援据确实，曲畅旁通，足以解惑辨疑。曾于一九三七年排印了史、子部未完稿十二卷，后全部定稿于一九五八年十月由科学出版社正式出版，一九八○年中华书局加标点重排出版，今据中华书局一九八○年本重印，并在书末增加了书名音序和笔画两种索引，以便使用。

本书包括中华书局一九六三年版《余嘉锡论学杂著》的全部内容，包括论文、书籍的序跋和杂考三类共三十篇及读书随笔三十条，此次新增读书随笔二十三条、七律四首、墓表一篇、附录《余嘉锡先生传略》一篇。所收多为著者一九四五年以前所写，涉及古籍的流传、古代书册制度的沿革、历史人物的事迹和生卒年月考证、重要历史文献中所反映的史实及目录书籍的源流和一般考勘的方法等等。内容充实，考证详密，对于研究古代历史、文献、小说、戏剧以及校勘学、目录学的人颇有参考价值。

《目录学发微》是著一九三二至一九四八年间在北京各大学主讲目录学课程时的讲义，本书以“辨章学术”为核心，建立了自己的目录学体系。对目录书的体制、目录学的源流、历代目录书的类例沿革阐述甚详，举出目录学的体制有四种类型：一为篇目，考一书之源流；二为叙录，考一人之源流；三为小序，考一家之源流；四为版本序跋，考一书之源流。此次出版，重排根据的版本是中华书局1963年本。《古书通例》（是一部从宏观角度研究古籍的专著，对于汉魏以前的古书，经过探微索隐，详加考证，分析归纳以阐明古书的通例。全书分四卷：一为案著录，二为明体例，三为论编次，四为辨附益，由此指出了研究阅读古籍的门径。本次出版，重排依据的版本是上海古籍出版社一九八五年《古书通例》。