《神奇宝贝(特别篇23)》故事是，仿佛在命运的引导下，小智与小茂来到七岛，一个接一个的考验向他们袭来！为了向强大的对手挑战，需要进一步增强实力，于是两人开始在老婆婆极梅的指导下修炼“终极绝招”来袭的敌人是DNA神奇宝贝代欧奇斯！在新天地中的战斗，早早地进入了未知的领域。

《神奇宝贝特别篇(27)》：神奇宝贝对战的最前线——对战开拓区！为了达到称霸全部对战设施的目标，米拉特与开拓之脑们展开了一轮又一轮的攻防战！可是，另一方面，一个神秘的邪恶的影子慢慢浮现出来……他的目标竟然是千年才苏醒一次的梦幻神奇宝贝——基拉祈！

火山突然停止活动！自然界能量平衡的崩溃导致芳缘大陆各地都出现了灾变！为了研究对策，训练馆首领们紧急集合！令风云变色的第18卷终于登场了！

《神奇宝贝》(特别篇13)中实力强劲的神奇宝贝不断地涌现，令你目不暇接！此外，火箭队的阴谋，使得剧情更加扑朔迷离，精彩动人！可千万不要错过高潮迭起的冒险之旅喔！立志成为最强的神奇宝贝训练师的小智，在冒险的征途中遇到了一位神秘少女：小蓝。

按照口袋妖怪的出版年序分为红蓝黄，金银，红蓝宝石，绿宝石，火红叶绿，以及未出的珍珠钻石