十月。大量的死鱼从深海漂到上海东岸。格林兰岛的冰盖在急剧消融。海水在以几乎每24小时一米的速度迅速上升。平均海拔只有五米的上海危在旦夕。而同时，世界各国在静止轨道上的卫星受到干扰。 李古力奉命到上海请老一辈科学家张大明出马协助，却发现张大明失踪。海洋学家禹红发现了张大明遗留的应对海水上升的论文批注，参加了搜寻张大明的行动。李古力和欧洲之鹈间谍分别在上海和杭州遭遇。 众多迹象显示，张大明去了格陵兰岛，而美国中情局的吉姆也已经在去格陵兰岛途中。大规模剧烈磁暴发生，许多通讯卫星消失，大部分通讯中断。上海民众开始向西撤离。 渔民的儿子20岁的唐强终于决定去上海打工。在抢救女友幼儿园孩子时被压到被水冲垮的房屋中。救援军队把女友和其他孩子强行撤离。带着李古力四人小队和禹红的包机上升到一万三千米高空时，突然出现异常云团，随即他们的飞机信号从地面雷达消失。 南极开始冰融，长江上游暴雨夹裹着奔腾的江水和沿岸汇集的湖水冲向低处的上海，海水倒灌而上。上海的最后一刻已经到来。

李古力一行到达从外星系来的南极人地心基地，了解到海水上升是外星来的金乌人所为。喜水的金乌人要淹没地球从而占据地球。 为了共同的利益，李古力上了金乌人的飞船，却没有发现任何金乌人，并且发现任何炸弹都无法摧毁金乌人的飞船。 王贵华在金乌飞船上探索的过程中手腕受伤，高雅妮在为他清洗伤口时发现了吸收水分的怪异生命。 在经历并战胜“幻觉走廊”、“2.5度空间”、“情绪牢笼”、“金鸟阵”给他们带来的困难和危险之后，李古力一行又陷入了金乌人的“水墙迷阵”，并且爱上了金乌人的“金乌之城” ——那里没有工作的概念、没有货币，物质的产生不是通过人类式的劳动，而是通过每个人做自己喜欢的事时产生的多余能量而完成。每个人都有属于自己漂亮的房屋，爱情也是简单而温馨。 李古力带领众人违背自己意志离开“金乌之城”后，遭到了金乌人的攻击，而后被俘，而禹红的基因让她意识突然觉醒，从而救了大家。 禹红凭着先辈的记忆指引，终于找到金乌人弱点所在。一番激战之后，金乌人飞船的隐形防护罩破灭，飞船被摧毁。 海水下降，上海得以拯救。

四月，正当缅甸新年，西南山区上吉村一百多人全部死于SARS病毒，病毒在8小时内将蔓延到香港机场，24小时之内，将有两亿人受到威胁。同时，欧洲发现就在该处存有十万多吨黄金，数量超过了全球现有黄金的总量，一旦流入市场，将会对全球经济造成毁灭性的破坏。作为中国神秘组织墨龙的成员，李古力带着由生物专家高雅妮、前特种兵关凯、信息技术专家王贵华组成的四人精英小队秘密前往缅甸调查。李古力小队一路遭受缅甸毒贩、假中情局雇佣军和缅甸变节军官的伏击。调查发现，这些人是受“欧洲之鹈”指使。几乎同时，在地球另一端的美国马里兰州巴尔的摩市的雷蝶森酒店发生的一起空姐谋杀案又和缅甸有关，这是巧合还是阴谋？途中，小队从假中情局雇佣军手中营救了美国中情局科技部情报人员，并发现他们出现的目的竟是追踪UFO和代号NJ的外星人。在中国经济和国民生命安全悬于一线的48个小时中，萨斯、黄金和UFO，迷局会怎样展开？ 答案就在《黄金：48小时》内！